MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011312	GACTC	2	10	1202720	1202729	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5502	NC_011312	AGA	3	9	1202752	1202760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_011312	ATC	2	6	1202762	1202767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_011312	ATG	2	6	1202775	1202780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_011312	AC	3	6	1202781	1202786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_011312	TTA	2	6	1202853	1202858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_011312	ATGC	2	8	1202903	1202910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_011312	A	7	7	1203006	1203012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_011312	ATT	2	6	1203098	1203103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_011312	T	6	6	1203250	1203255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_011312	AAC	2	6	1203261	1203266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_011312	TGA	2	6	1203280	1203285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_011312	AAC	2	6	1203286	1203291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_011312	CACG	2	8	1203521	1203528	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_011312	CGA	2	6	1203530	1203535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_011312	TTA	2	6	1203627	1203632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_011312	CAGA	2	8	1203669	1203676	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5518	NC_011312	TGA	2	6	1203806	1203811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_011312	AGCG	2	8	1203844	1203851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5520	NC_011312	ACC	2	6	1204137	1204142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_011312	ACC	3	9	1204185	1204193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_011312	CCA	2	6	1204252	1204257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_011312	TGT	2	6	1204274	1204279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_011312	CTG	2	6	1204364	1204369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_011312	GCG	3	9	1204408	1204416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_011312	ATG	2	6	1204567	1204572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011312	CCG	2	6	1204573	1204578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_011312	TCT	2	6	1204627	1204632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_011312	AAG	2	6	1204639	1204644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_011312	T	6	6	1204647	1204652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_011312	GGCAAC	2	12	1204674	1204685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_011312	CTT	2	6	1204781	1204786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_011312	GTT	2	6	1204893	1204898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_011312	CAC	2	6	1204973	1204978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_011312	CTG	2	6	1205033	1205038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_011312	C	6	6	1205091	1205096	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5537	NC_011312	AGA	2	6	1205277	1205282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_011312	TAAG	2	8	1205382	1205389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_011312	GAC	2	6	1205390	1205395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_011312	CAT	2	6	1205493	1205498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_011312	CAG	2	6	1205504	1205509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_011312	TGC	2	6	1205529	1205534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_011312	TTGA	2	8	1205535	1205542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_011312	CAGCC	2	10	1205627	1205636	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5545	NC_011312	TTTTGC	2	12	1205667	1205678	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5546	NC_011312	TGC	2	6	1205754	1205759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_011312	ATT	2	6	1205760	1205765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_011312	TCA	2	6	1205881	1205886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_011312	CCA	2	6	1205887	1205892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_011312	ACG	2	6	1205922	1205927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_011312	CTT	2	6	1205957	1205962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_011312	ACAGT	2	10	1205971	1205980	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5553	NC_011312	ATAC	2	8	1206006	1206013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_011312	AGA	3	9	1206066	1206074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_011312	CAG	2	6	1206128	1206133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_011312	GTT	2	6	1206136	1206141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_011312	TTGTA	2	10	1206142	1206151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_011312	ACA	3	9	1206343	1206351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_011312	ATC	2	6	1206378	1206383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_011312	AAG	2	6	1206428	1206433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_011312	TGA	2	6	1206453	1206458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_011312	ACGA	2	8	1206492	1206499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_011312	CCG	2	6	1206515	1206520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_011312	ATT	2	6	1206672	1206677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_011312	ATT	2	6	1206705	1206710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_011312	ATT	2	6	1207242	1207247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_011312	AGA	2	6	1207249	1207254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011312	TTGAT	2	10	1207290	1207299	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_011312	AATTT	2	10	1207335	1207344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_011312	AAT	2	6	1207350	1207355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_011312	TGT	2	6	1207367	1207372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_011312	CA	3	6	1207415	1207420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_011312	GCT	2	6	1207435	1207440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_011312	GGA	2	6	1207480	1207485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_011312	TGT	2	6	1207505	1207510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_011312	GA	4	8	1207521	1207528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_011312	TTA	2	6	1207529	1207534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_011312	A	6	6	1207568	1207573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_011312	TTAA	2	8	1207586	1207593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_011312	ACA	2	6	1207594	1207599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_011312	T	6	6	1208538	1208543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_011312	GAA	2	6	1208656	1208661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_011312	TTA	2	6	1208694	1208699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_011312	A	6	6	1208816	1208821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_011312	TTTAT	2	10	1208826	1208835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_011312	ACTT	2	8	1208862	1208869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_011312	ATTC	2	8	1208893	1208900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_011312	TTA	2	6	1208927	1208932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_011312	TA	3	6	1208969	1208974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_011312	TATTG	2	10	1208996	1209005	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_011312	TTG	2	6	1209703	1209708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_011312	TGA	2	6	1209833	1209838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_011312	GAA	2	6	1209885	1209890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_011312	TTG	2	6	1209909	1209914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_011312	ACT	2	6	1209919	1209924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_011312	TCT	2	6	1209998	1210003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_011312	ATA	2	6	1210041	1210046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_011312	CTT	2	6	1210109	1210114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_011312	T	6	6	1210136	1210141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_011312	ATA	2	6	1210158	1210163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_011312	A	6	6	1210171	1210176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_011312	AG	3	6	1210182	1210187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_011312	TAAA	2	8	1210254	1210261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_011312	C	6	6	1210284	1210289	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5605	NC_011312	TCA	2	6	1210303	1210308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_011312	CGT	2	6	1210370	1210375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_011312	GAC	2	6	1210383	1210388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_011312	GTAA	2	8	1210429	1210436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_011312	TAT	2	6	1210448	1210453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_011312	CCA	2	6	1210467	1210472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_011312	TTG	2	6	1210473	1210478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_011312	TGA	2	6	1210569	1210574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_011312	TCT	2	6	1210642	1210647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_011312	TCG	2	6	1210655	1210660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_011312	TAA	3	9	1210677	1210685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_011312	ACTG	2	8	1210707	1210714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5617	NC_011312	T	7	7	1210769	1210775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_011312	TTC	2	6	1210797	1210802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_011312	TCA	2	6	1211082	1211087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_011312	GTT	2	6	1211092	1211097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_011312	AAT	3	9	1211162	1211170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_011312	ATT	3	9	1211324	1211332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_011312	TTG	2	6	1211390	1211395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_011312	TTC	2	6	1211444	1211449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_011312	ATT	2	6	1211534	1211539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_011312	TAA	2	6	1211579	1211584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_011312	CTT	2	6	1211620	1211625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_011312	T	6	6	1211630	1211635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_011312	TGT	2	6	1211640	1211645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_011312	TGAT	2	8	1211681	1211688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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